基本信息
- 项目名称:
- 提取基因组DNA的优化方法
- 来源:
- 第十二届“挑战杯”省赛作品
- 小类:
- 生命科学
- 大类:
- 自然科学类学术论文
- 简介:
- 针对传统基因组DNA提取方法存在的问题,本组成员提出该优化方法,此方法操作简单、节省时间、无毒安全且纯度较高,值得在今后的分子生物学领域广泛推广、运用。
- 详细介绍:
- 以大泷六线鱼(Hexagrammos otakii Jordan et Starks)的大侧肌肌肉为材料,分别采用传统的苯酚-氯仿法和优化的基因组DNA提取方法提取大泷六线鱼基因组DNA。对两种方法提取的结果进行了紫外分光光度和琼脂糖凝胶电泳检测。结果显示,本优化方法提取的鱼类基因组DNA的D260nm/D280nm比值为1.66~1.68,传统方法提取的DNA的D260nm/D280nm比值为1.71~1.90,均在正常范围之内。琼脂糖凝胶电泳检测结果显示两种方法所提取的DNA的浓度没有显著差异。所提取的DNA可以满足相关分子生物学研究的需要。而且优化后的方法操作更为简洁,操作过程中避免了实验人员与毒性较大的苯酚、氯仿的接触。因此,该基因组DNA提取方法效果较好,具有一定的应用价值。
作品专业信息
撰写目的和基本思路
- 研究鱼类基因组DNA提取的优化方法在分子生物学基础上对传统基因组DNA提取方法的优化
科学性、先进性及独特之处
- 实验在专业实验室中进行,采取对比的科学实验方法,确保了实验的规范性和数据的准确性;本实验避免了与毒性较大的苯酚、氯仿的接触,实验时间较短,操作简便;值得在分子生物学领域广泛推广。
应用价值和现实意义
- 本优化方法更有利于基因组DNA的提取,实验过程简便、安全,更有利于实验员实际操作,为分子生物学的发展奠定基础。
学术论文摘要
- 以大泷六线鱼(Hexagrammos otakii Jordan et Starks)的大侧肌肌肉为材料,分别采用传统的苯酚-氯仿法和优化基因组DNA提取方法提取大泷六线鱼基因组DNA。对两种方法提取的结果进行了紫外分光光度和琼脂糖凝胶电泳检测。结果显示,本优化方法提取的鱼类基因组DNA的D260nm/D280nm比值为1.66~1.68,传统方法提取的DNA的D260nm/D280nm比值为1.71~1.90,均在正常范围之内。琼脂糖凝胶电泳检测结果显示两种方法所提取的DNA的浓度没有显著差异。所提取的DNA可以满足相关分子生物学研究的需要。而且优化后的方法操作更为简洁,操作过程中避免了实验人员与毒性较大的苯酚、氯仿的接触。因此,该基因组DNA提取方法效果较好,具有一定的应用价值。
获奖情况
- 大连海洋大学初评二等奖
鉴定结果
- 实验结果达到了预期效果
参考文献
- [1]刘 臻、鲁双庆、肖调义、陈开键。鲫鱼基因组DNA 提取方法的探讨,水利渔业,2004,24(6):20~22 [2]张德华、周开亚 、孙红英。乙醇保存的动物标本基因组DNA 提取方法的比较,生物学杂志,2004,21(6):46~48 [3] 马洪雨、姜运良、岳永生。一种从鱼类肌肉组织中提取基因组,的简易方法,生物技术通讯,2005,16(5):531~532 [4]张锐 、孙美榕 、林洽辉、杨燕贞、曾苑玲。鱼类基因组DNA提取方法的优化及PCR扩增,水利渔业,2006,26(4):7~9 [5]乐小亮、章群赵爽、范凤娟 。一种高效快速的鱼类标本基因组DNA提取方法,生物技术通报,2010,(2):202~204 [6]张继民、刘霜 一、赵建民 、马兆党、张洪亮 。带鱼(Trichiurus haumela)鱼卵DNA的提取及其18SrDNA初步分析,海洋通,2009,28(6):62~65 [7]李明云、张海琪。大黄鱼高质量基因组DNA的简便提取方法,实验与技术,2002,26(10):15~17 [8]张祖兴、李明云、张春丹、刘伟成、管丹冬 。大黄鱼血液基因组DNA的提取及其效果,水利渔业,2006,26(3):24~25 [9]汪立平、马相杰、赵勇。罗非鱼幼鱼肠道微生物基因组DNA的提取;湖南农业科学;2009,(10):147~15 [10] 汪永庆、王新国、徐来祥等。一种动物基因组DNA提取方法的改进,动物学杂志,2001,36(1):27~29
同类课题研究水平概述
- 近年来我国水产行业发展迅速,市场对水产品的需求量越来越大,导致野生水生资源的匮乏;同时,对养殖品种的质量要求也在不断提高,故为了保护和开发我国水产生物资源 ,了解和研究其遗传特性, 分子生物学技术必将成为其遗传分析和品种改良的有力工具之一, 而提取高质量的鱼基因组DNA是进行各种分子生物学研究的基础和前提。尽管当前国内外对基因组DNA的提取方法在不断改进、优化,从试剂盒法到苯酚-氯仿提取法,所用技术不断更新,操作也逐渐简化,提取的基因组DNA的纯度也在不断提高,而我们的优化方法在过去传统方法的基础上进行改进,提取的基因组DNA清晰度、完整度、纯度与以往方法均无明显差异,但我们的方法实验时间较短,操作简便,避免了与毒性较大的苯酚、氯仿的接触,对于提取基因组DNA不失为一种更好的方法,但整个实验操作过程仍有些许值得改进的地方,愿后来者继续改进,为分子生物学的科技进步贡献力量!