基本信息
- 项目名称：
- A型流感病毒NS1蛋白抑制剂的虚拟筛选
- 来源：
- 第十二届“挑战杯”省赛作品
- 小类：
- 生命科学
- 大类：
- 自然科学类学术论文
- 简介：
- 本文以禽流感病毒N-端RNA结合域(RBD)为靶点,以NCI 和Maybridge数据库中20万个小分子为筛选对象，建立了NS1抑制剂的虚拟筛选方法。经过两轮筛选(初步筛选与精细对接)确定出17个可能的先导化合物。
- 详细介绍：
- 目前关于NS1A抑制剂的研究报导较少，仅有通过高通量筛选的方法筛选出几个有活性的化合物分子。本文以禽流感病毒N-端RNA结合域(RBD)为靶点,以NCI 和Maybridge数据库中20万个小分子为筛选对象，建立了NS1抑制剂的虚拟筛选方法。经过两轮筛选(初步筛选与精细对接)确定出17个可能的先导化合物，这些化合物的结构基团特性与已知抑制剂相似，对其结合模式进行初步分析后发现先导化合物与NS1蛋白具有较强的亲和力，能够形成氢键等稳定的相互作用力。本研究中所筛选出的NS1可能的先导化合物及其与NS1抑制剂结合模式的分析为新型NS1抑制剂的研究奠定了基础。
作品专业信息
撰写目的和基本思路
- 依赖于已建立的禽流感病毒NS1蛋白数据库中的NS1蛋白资源，在省工程中心的高效计算机平台上，以A型流感病毒NS1蛋白N端RBD结合口袋为靶点, 以其虚拟筛选筛选NS1蛋白抑制剂的化合物。
科学性、先进性及独特之处
- 筛选出的NS1可能的抑制剂先导化合物评价较好，为新型NS1抑制剂的研究提供参考
应用价值和现实意义
- 本研究基于分子对接配体受体相互作用的原理，以流感病毒NS1蛋白三维结构两功能位点为靶点，利用高性能计算机虚拟筛选的评价较高抑制剂分子，将建立一种全新的筛选抗流感病毒药物的方法，将大大缩短新药物的研发时间，节省大量的人力和物力。该方法将在辽宁省生物大分子计算模拟与信息处理工程研究中心转化为科研成果，可以进一步应用于其他相关项目研究，该方法的推广将产生巨大的经济和社会效益。
学术论文摘要
- A型流感病毒是一种严重危害人类以及畜禽健康的致命性病毒，而且历史上几次流感大流行也都由A型流感病毒引起。A型流感病毒NS1蛋白是病毒的复制、传播、发病机理非常依赖的蛋白，现已被证明是抗流感药物作用的靶蛋白质，尤其是N-端RNA结合域(RNA-binding domain,RBD)是抗流感药物作用的一个潜在靶点。 本文以A型流感病毒NS1蛋白RBD结合口袋为靶点, 以NCI 和Maybridge数据库中的20万个小分子为筛选对象，建立了NS1抑制剂的虚拟筛选方法。经过两轮筛选(初步筛选与精细对接)确定出17个可能的先导化合物，这些化合物的结构基团特性与已知抑制剂相似，对其结合模式进行初步分析后发现先导化合物与NS1蛋白具有较强的亲和力，能够形成氢键等相互作用力，本研究中所筛选出的NS1可能的先导抑制剂化合物及其与受体结合模式的分析为新型NS1抑制剂的研究奠定了基础。
获奖情况
- 无
鉴定结果
- 无
参考文献
- 1.Monto, A. S., and R. J. Whitley. Seasonal and pandemic influenza: a 2007 update on challenges and solutions. Clin. Infect. Dis, 2008.,46:1024–1031. 2.Dipanwita Basu, Marcin P. Walkiewicz, Matthew Frieman, et al.Novel Influenza Virus NS1 Antagonists Block Replication and Restore Innate Immune Function.[J]. Jounal of Virology, 2009,83(4):1881-1891.
同类课题研究水平概述
- 现阶段关于NS1A抑制剂的研究报导不多，其中以NS1ARBD为靶点的主要有Basu等[57]人建立了酵母筛选模型成功筛选出四个具有很高活性的化合物可以抑制A型流感病毒不同毒株的复制，此外Maroto等[58]也通过高通量筛选的方法发现了一些先导化合物，但资料未公开；这证明了NS1A作为药物靶标的合理性和有效性。
