基本信息
- 项目名称:
- 杨梅Cu/Zn超氧化物歧化酶基因(MrSOD1)cDNA的克隆及表达分析
- 来源:
- 第十二届“挑战杯”省赛作品
- 小类:
- 生命科学
- 大类:
- 自然科学类学术论文
- 简介:
- 本研究以杨梅叶为材料,提取总RNA,根据植物Cu/Zn超氧化物歧化酶的5′和3′末端设计简并引物,利用RT-PCR技术,从杨梅叶中克隆到一个Cu/Zn超氧化物歧化酶基因MrSOD1(Genbank accession No. GQ404510)编码区全长cDNA序列。
- 详细介绍:
- 本研究以杨梅叶为材料,提取总RNA,根据植物Cu/Zn超氧化物歧化酶的5′和3′末端设计简并引物,利用RT-PCR技术,从杨梅叶中克隆到一个Cu/Zn超氧化物歧化酶基因MrSOD1(Genbank accession No. GQ404510)编码区全长cDNA序列,长度为461 bp。该基因编码一个由152 个氨基酸残基组成的蛋白质。杨梅MrSOD1具有Cu/Zn超氧化物歧化酶的特征信号序列GFHVHAlGDtT和GNAGgRvACgiI。序列同源性分析表明,杨梅MrSOD1与GenBank中注册的SOD序列的同源性均在77%以上。蛋白疏水性分析显示,杨梅MrSOD1具2 个明显的跨膜区。半定量RT-PCR分析显示,MrSOD1在杨梅叶、枝条、果和花4 种组织中均有表达,其表达量为果>叶>花>枝条,相对表达量分别为1.1489、0.2376、2.8714和1.0321。
作品专业信息
撰写目的和基本思路
- 超氧化物歧化酶是植物体内活性氧清除系统中的抗氧化酶,该酶在逆境胁迫下增强表达能够提高植物清除活性氧的能力,增加植物的抗逆性。本项目旨在克隆杨梅超氧化物歧化酶基因,并分析该基因表达模式,为探索其调控途径及杨梅抗氧化伤害的分子机理奠定基础。
科学性、先进性及独特之处
- 以杨梅为研究对象进行SOD基因与植物抗逆性关系的研究迄今尚未见报道。
应用价值和现实意义
- 本研究旨在克隆杨梅超氧化物歧化酶基因(该基因命名为MrSOD1)的cDNA序列,为研究该基因时空表达特性,探索其调控途径及杨梅抗氧化伤害的分子机理奠定基础。
学术论文摘要
- 本研究以杨梅叶为材料,提取总RNA,根据植物Cu/Zn超氧化物歧化酶的5′和3′末端设计简并引物,利用RT-PCR技术,从杨梅叶中克隆到一个Cu/Zn超氧化物歧化酶基因MrSOD1(Genbank accession No. GQ404510)编码区全长cDNA序列,长度为461 bp。该基因编码一个由152 个氨基酸残基组成的蛋白质。杨梅MrSOD1具有Cu/Zn超氧化物歧化酶的特征信号序列GFHVHAlGDtT和GNAGgRvACgiI。序列同源性分析表明,杨梅MrSOD1与GenBank中注册的SOD序列的同源性均在77%以上。蛋白疏水性分析显示,杨梅MrSOD1具2 个明显的跨膜区。半定量RT-PCR分析显示,MrSOD1在杨梅叶、枝条、果和花4 种组织中均有表达,其表达量为果>叶>花>枝条,相对表达量分别为1.1489、0.2376、2.8714和1.0321。
获奖情况
- 无
鉴定结果
- 无
参考文献
- [1] McCord J M, Fridovich I. Superoxide dismutase. an enzymic function for erythrocuprein (hemocuprein)[J]. J. Biol. Chem., 1969,244(22):6049–6055. [2] Ma X J, Zhu D H. Functional roles of the plant superoxide dismutase[J]. Hereditas, 2003,25(2):225-231. [3] Kim E J, Kim H P, Hah Y C, et al. Differential expression of superoxide dismutases containing Ni and Fe/Zn in Streptomyces coelicotor[J]. Eur. J. Biochem., 1996,(241):178-185. [4] Tsang E W, Bowler C, Herouart D, et al. Differential regulation of superoxide dismutases in plants exposed to environmental stress[J]. Plant Cell, 1991,3(8):783-792. [5] Perl T R, Galun E. The tomato Cu, Zn superoxide dismutase genes are developmentally regulated and respond to light and stress[J]. Plant Mol. Biol., 1991,(17):745-760.
同类课题研究水平概述
- 自从第一个植物SOD基因从玉米中克隆以后,植物SOD基因的克隆在国外进展迅速。科研工作者主要从一些经济作物中得到SOD基因的cDNA序列或表达序列标签(expressed sequence tags,EST)。Fe-SOD基因也从水稻(Oryza sativa L.)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)、大豆(Glycine max)、白花丹叶烟草(Nicoliana plumbaginifolia)和樟树(Cinnamomum camphora)等高等植物中得到克隆。Cu/Zn-SOD有较多的保守位点。这为同源PCR克隆策略提供了依据。 杨梅(Myrica rubra (Lour) Sieb. and Zucc.)是双子叶纲杨梅科(Mycicaceae)杨梅属(Myrica L.)常绿灌木或小乔木,是原产于中国的亚热带果树之一。杨梅喜温暖湿润气候,耐阴,喜排水良好的酸性土,微碱性土壤也能适应,深根性,萌芽力强。以杨梅为研究对象进行SOD基因与植物抗逆性关系的研究迄今尚未见报道。本研究旨在克隆杨梅超氧化物歧化酶基因(该基因命名为MrSOD1)的cDNA序列,为研究该基因时空表达特性,探索其调控途径及杨梅抗氧化伤害的分子机理奠定基础。